Nou seqüenciador: el MiSeq i100 Plus (Illumina)

L’any 2012 i sota la direcció de la Dra. Anna Barceló, el Servei de Genòmica va adquirir el primer seqüenciador de seqüenciació massiva, el MiSeq Sequencing System. Aquest, va ser cofinançat per la Unió Europea amb els fons FEDER (Fondo Europeo de Desarrollo Regional).

A causa de l’obsolescència de l’equip actual, l’SGiEB ha decidit actualitzar novament el seu equipament, amb el cofinançament de la UAB. Aquesta renovació permet posar a disposició dels usuaris el nou model d’Illumina disponible al mercat des del 2025: el MiSeq i100 Plus.

Quines avantatges ofereix el MiSeq i100 Plus?

• Rapidesa: gràcies a la nova química XLEAP d’Illumina, incorporada per Illumina el 2024, les seqüenciacions són 4 vegades més ràpides. Aquesta mateixa química ja s’utilitza a l’equip NextSeq1000, també disponible a l’SGiEB.
• Òptica simplificada: les flow cells tenen un sensor d’imatge CMOS incrustat capaç de detectar directament les emissions de fluorescència. Això permet prescindir del mòdul òptic convencional i dels seus components mecànics, fent que el MiSeq i100 Plus sigui ser un equip més compacte, silenciós i fàcil de manipular i mantenir.
• Capacitat i rendiment: així com amb el MiSeq no podíem oferir més de 15 M de lectures o reads (8.5 Gb), amb el MiSeq i100 Plus podrem oferir flow cells de 5M, 25M, 50M i 100M de reads, adaptant-nos millor a les necessitats de cada projecte.
• Longitud de lectura: amb el MiSeq podíem generar single-reads de 300 i 500 parells de bases (bp) amb la química V2. Amb el MiSeq i100Plus podrem ampliar aquest rang ja que permet obtenir single-reads de 100, 300 i 600 bp (*), al igual que el NextSeq1000.
• Sostenibilitat: els cartutxos i consumibles no requereixen refrigeració, ja que estan liofilitzats i són reconstituïts automàticament dins del seqüenciador. Això simplifica el transport i l’emmagatzematge, redueix costos i consum energètic i redueix el volum d’embalatge respecte el MiSeq.

(*) també hi ha disponible un kit de 2x500 bp (1000 cicles) només compatible amb la flow cell de 25M.