Desarrollan una base de datos que permite identificar los genes clave para las infecciones bacterianas
Científicos de la UAB y del CRG ha creado una base de datos, llamada BacFITBase, que cataloga los genes bacterianos relevantes en los procesos de infección de organismos vivos y facilitará la identificación de nuevas dianas terapéuticas para producir nuevos antibióticos.

Un equipo de investigación del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la Universitat Autònoma de Barcelona y del Centro de Regulación Genómica (CRG) ha creado la base de datos BacFITBase. A partir de resultados de experimentos in vivo, los investigadores han catalogado de manera sistemática los genes bacterianos que tienen relevancia en la invasión y la infección del huésped. Todos los experimentos considerados se basan en una técnica llamada mutagénesis por transposón, donde unos fragmentos de ADN llamados transposones son transferidos a los genes del organismo patógeno, inactivando los mismos. De esta manera se puede observar directamente su papel en la infección y determinar cuáles son esenciales para infectar un organismo huésped específico. Así pues, esta base de datos facilitará la tarea de identificar proteínas diana para la lucha contra las enfermedades infecciosas y acelerará el desarrollo de nuevos agentes antimicrobianos.
La base de datos contiene más de 90.000 entradas con información sobre cómo contribuyen genes concretos de las bacterias patógenas en condiciones de infecciones in vivo en cinco especies diferentes de huésped. En total incluye información de 15 bacterias (dos variantes de Salmonella enterica, Haemophilus influenzae, Streptococcus pyogenes, Porphyromonas gingivalis, Mycobacterium avium, tres variantes de Escherichia coli, Vibrio cholerae, Campylobacter jejuni, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Serratia marcescens y Vibrio parahaemolyticus ) y 5 vertebrados huésped (vaca, cerdo, pollo, ratón y conejo) con información sobre 10 tejidos diferentes.
BacFITBase, publicada en la revista Nucleic Acids Research, ha sido desarrollada por los investigadores del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la UAB Javier Macho y Marc Torrent, junto con los investigadores del Centro de Regulación Genómica (CRG) Benjamin Lang y Gian Gaetao Tartaglia.
Más información:
La base de datos se puede consultar en:
http://www.tartaglialab.com/bacfitbase
Referencia:
Macho Rendón, Javier; Lang, Benjamin; Tartaglia, Gian & Torrent, Marc. BacFITBase: a database to assess the relevance of bacterial genes during host infection. Nucleic Acids Research. (2019). DOI: 10.1093/nar/gkz931.