Nou article: "AGGRESCAN and its evolution: A two-decade perspective on protein aggregation prediction"

Abstract:

L'agregació de proteïnes és un fenomen generalitzat amb profundes implicacions biològiques, biomèdiques i biotecnològiques. En les malalties humanes, l'autoensamblatge aberrant de proteïnes és un tret distintiu de nombrosos trastorns neurodegeneratius, mentre que en la indústria biofarmacèutica, l'agregació complica la producció, l'estabilitat i la formulació de proteïnes terapèutiques. La plataforma Aggrescan va ser una de les primeres eines empíriques dissenyades per predir regions propenses a l'agregació (APR) dins de les seqüències de proteïnes. Des de llavors s'ha ampliat per incorporar contextos estructurals tridimensionals i condicions ambientals. Aquesta revisió proporciona una visió general completa del desenvolupament, l'aplicació i l'impacte de la família d'eines Aggrescan, que inclou AGGRESCAN, Aggrescan3D i el recent Aggrescan4D. Examinem els fonaments algorítmics, la validació empírica i els casos d'ús clau que abasten camps des de la biotecnologia fins a la recerca biomèdica. A més, descrivim com la recent integració dels models AlphaFold ha permès l'exploració a escala de proteoma dels determinants de l'agregació. Aquesta revisió destaca com Aggrescan ha evolucionat juntament amb els avenços en el camp, convertint-se en una eina fiable i accessible per estudiar i redissenyar l'agregació de proteïnes.

Dades article:

Giulia Pesce, Oriol Solé, Oriol Bárcenas, Salvador Ventura. AGGRESCAN and its evolution: A two-decade perspective on protein aggregation prediction. Biophys Rev (2026). https://doi.org/10.1007/s12551-025-01404-9

DOI: 10.1007/s12551-025-01404-9