Nou article: “Databases of liquid–liquid phase separation proteins and condensates”
Grup de recerca: Plegament de Proteïnes i Malalties Conformacionals
Resum:
La separació de fases líquid-líquid de proteïnes (LLPS) i la formació de condensats biomoleculars són cada vegada més reconegudes com a processos fonamentals tant en la fisiologia com en la patologia cel·lular. Tanmateix, les bases de dades computacionals desenvolupades per catalogar les proteïnes associades a la LLPS difereixen significativament pel que fa al seu abast, les seves estratègies de curació, els seus models d'evidència i el grau de detall de les anotacions. En aquest treball, comparem les principals bases de dades de LLPS, analitzem quins aspectes descriu millor cada recurs, en quins punts divergeixen les definicions dels rols i els models d'evidència, quines metadades continuen essent limitades i com aquestes diferències afecten la interpretació i la reutilització de les dades. Defensem que els futurs recursos haurien de prioritzar vocabularis interoperables, una identificació explícita de l'origen de les dades, anotacions dependents de les condicions experimentals i una integració més sòlida amb informació sobre regions proteiques, estructura i mutacions.
Dades article:
Carlos Pintado-Grima, Michał Burdukiewicz, Salvador Ventura. Databases of liquid–liquid phase separation proteins and condensates. Current Opinion in Structural Biology, Volume 100, 2026. ISSN 0959440X. https://doi.org/10.1016/j.sbi.2026.103341.
La UAB, amb els Objectius de Desenvolupament Sostenible
-
Salut i benestar