Nou article: "Chromosome-Level Genomics and Historical Museum Collections Reveal New Insights Into the Population Structure and Chromosome Evolution of Waterbuck"

Abstract:

Els avenços en la seqüenciació i l'assemblatge a escala cromosòmica han posat el focus en els animals no model, aprofundint la nostra comprensió de l'evolució del genoma i els cromosomes. Aquí, presentem l'antílop aquàtic (Kobus ellipsiprymnus) com un antílop model emergent per estudiar la dinàmica de poblacions i l'evolució cromosòmica. La història evolutiva de l'antílop aquàtic ha estat modelada tant pels canvis climàtics com geogràfics, així com pels canvis estructurals dels cromosomes, principalment les fusions robertsonianes (Rb). Per proporcionar nous coneixements sobre la seva evolució, vam generar un assemblatge del genoma a nivell cromosòmic per a l'espècie mitjançant la seqüenciació PacBio HiFi i Hi-C. A més, vam aprofitar les col·leccions dels museus per realitzar la seqüenciació del genoma complet (WGS) de 24 exemplars històrics. Combinat amb un conjunt de dades WGS anterior (n = 119), aquest representa l'estudi més gran de poblacions d'antílops aquàtics fins ara i revela una estructura poblacional i un flux genètic entre les poblacions d'antílops aquàtics prèviament desconeguts, juntament amb diverses regions d'alta diferenciació genòmica entre les dues subespècies reconegudes. Cal destacar que diversos punts calents de diferenciació es produeixen a prop dels centròmers de fusions de Rb fixes i polimòrfiques, que presenten signatures de baixa recombinació i estructura de població local. Aquestes regions contenen gens implicats en el desenvolupament, la fertilitat i la recombinació. Les nostres troballes subratllen el valor dels assemblatges genòmics a nivell cromosòmic, el paper crític de les col·leccions històriques en la captura de l'estructura de població a petita escala i el flux genètic en espècies amb distribucions àmplies, i els possibles impactes evolutius de les fusions de Rb en els paisatges de diferenciació i recombinació genòmica.

Dades article:

Kirkland C, Wang X, Canedo-Ribeiro C, Álvarez-González L, Weisz D, Mena A, Leger JS, Dudchenko O, Lieberman Aiden E, Ruiz-Herrera A, Heller R, King T, Farré M. Chromosome-Level Genomics and Historical Museum Collections Reveal New Insights Into the Population Structure and Chromosome Evolution of Waterbuck. Mol Ecol. 2026 Jan;35(1):e70218. doi: 10.1111/mec.70218.

DOI: 10.1111/mec.70218