Personal del departament

Professor Emèrit. Dept. de Bioquímica i Biologia Molecular, UAB (2019-actualitat)
Catedràtic. Dept. de Bioquímica i Biologia Molecular, UAB (1999-2019)
Professor Titular. Dept. de Bioquímica i Biologia Molecular, UAB (1985-98)
Professor Adjunt. Dept. de Bioquímica, UAB (1981-84)
Postdoctorat. Dept. of Chemistry, Columbia University, New York (1980-81)
Postdoctorat. Institut de Biologia Fonamental, UAB (1977-79)
Doctorat en Ciències. Institut de Biologia Fonamental, UAB (1973-76)
Llicenciatura en Ciències Químiques. Universitat de Barcelona (1968-73)
Enginyeria Tècnica Industrial Química. Escola Industrial, Barcelona (1963-68)

El nostre grup va estar interessat en l'estudi de l'estructura de la cromatina en presència de concentracions intermèdies de cations divalents. Els nostres resultats ens van portar a proposar el model del solenoide interdigitat per a la fibra de 30 nm, que ara és àmpliament acceptat en la literatura de la cromatina. Des de l'any 2000, hem estat interessats en l'estructura de la cromatina en presència de concentracions de cations més elevades, similars a les observades en els cromosomes en metafase. Hem descobert que en els cromosomes condensats, la cromatina s'empaqueta densament formant estructures en forma de plaques, en lloc de les fibres típiques considerades en els models actuals dels cromosomes en metafase. Les nostres imatges de microscòpia electrònica han demostrat que les plaques dels cromosomes poden contenir diverses capes, amb un gruix d'aproximadament 6 nm cada capa. Aquestes observacions i altres estudis estructurals realitzats amb microscòpia de força atòmica ens han permès suggerir el model de les plaques primes per al plegament de la cromatina en els cromosomes metafàsics, en el qual vàrem proposar que els cromosomes estan formats per moltes plaques apilades orientades perpendicularment respecte a l'eix de la cromàtide. Aquest model permet una explicació física simple dels patrons de bandes característics dels cromosomes en metafase obtinguts en estudis citogenètics. També hem observat mitjançant tomografia electrònica i microscòpia de polarització que els nucleosomes estan orientats irregularment en les plaques ben definides que ocupen tot el volum de la cromàtide. Per justificar el petit gruix observat per les plaques, hem suggerit que hi ha una interdigitació entre les capes successives. L'estructura compacta resultant és necessària per a la transferència segura del DNA genòmic a les cèl·lules filles durant la mitosi. Més recentment, hem utilitzat tècniques de dispersió de raigs X de sincrotró i de crio-tomografia electrònica per estudiar l'estructura interna i les propietats físiques de les plaques de cromatina. Actualment, estem realitzant estudis teòrics i de modelatge sobre les possibles funcions biològiques de l'auto-organització multilaminar dels cromosomes.

- JR. Daban & A. Bermúdez (1998) Interdigitated solenoid model for compact chromatin fibers. Biochemistry 37:4299-4304
- JR. Daban (2000) Physical constraints in the condensation of eukaryotic chromosomes. Local concentration of DNA versus lineal packing ratio in higher order chromatin structures. Bochemistry 39:3861-3866.
- JR. Daban (2003) High concentration of DNA in condensed chromatin. Biochem. Cell Biol. 81:91-99.
- JM. Caravaca, S. Caño, I. Gállego & JR. Daban (2005) Structural elements of bulk chromatin within metaphase chromosomes, Chromosome Res 13:725-743.
- I. Gállego, P. Castro-Hartmann , JM Caravaca, S. Caño & J.R. Daban (2009) Dense chromatin plates in metaphase chromosomes. Eur Biophys J 38:503-522.
- P. Castro-Hartmann, M. Milla  & JR. Daban (2010) Irregular orientation of nucleosomes in the well-defined chromatin plates of metaphase chromosomes. Biochemistry 49: 4043-4050.
- I. Gállego, G. Oncins, X. Sisquella, X. Fernández-Busquets & JR. Daban (2010) Nanotribology results show that DNA forms a mechanically resistant 2D network in metaphase chromatin plates. Biophys J 99:3951-3958.
- JR. Daban (2011) Electron microscopy and atomic force microscopy studies of chromatin and metaphase chromosome structure. Micron 42:733-750.
- M. Milla & JR. Daban (2012) Self-assembly of thin plates from micrococcal nuclease-digested chromatin of metaphase chromosomes. Biophys J 103:567-575.
- JR. Daban (2014) The energy components of stacked chromatin layers explain the morphology, dimensions and mechanical properties of metaphase chromosomes. J Royal Soc Interface 11: 20131043.
- JR. Daban (2015) Stacked thin layers of metaphase chromatin explain the geometry of chromosome rearrangements and banding. Scientific Reports 5:14891.
- A. Chicano,  E. Crosas,  J. Otón,  R. Melero, BD. Engel & JR. Daban (2019) Frozen-hydrated chromatin from metaphase chromosomes has an interdigitated multilayer structure.
EMBO J. 38:e99769.
- A. Chicano & JR. Daban (2019) Chromatin plates in the interphase nucleus. FEBS Lett. 593:810-819.
- JR. Daban (2020) Supramolecular multilayer organization of chromosomes: possible functional roles of planarchromatin in gene expression and DNA replication and repair. FEBS Lett. 594:395-411.
- JR. Daban (2021) Multilayer organization of chromosomes. In Cytogenomics (Editor: T. Liehr), Academic Press (Elsevier).
- JR. Daban (2021) Soft-matter properties of multilayer chromosomes. Physical Biology, 18:053001.