A la revista "l'autònoma" del mes de novembre hem pogut llegir com l'investigador Antonio Barbadilla, del Departament de Genètica i de Microbiologia, en col·laboració amb els investigadors Miquel Àngel Senar i Elisa Heymann, professors del Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius que imparteixen docència al nostre centre, han endegat un projecte en biologia: crear la primera base de dades on els investigadors de tot el món puguin cercar petites variacions entre els gens de diferents individus i espècies animals. Ja s'ha fet un primer pas de prova: la creació de la base de dades que recull la diversitat genètica del gènere Drosophila (la mosca de la fruita), el més estudiat pels genetistes.

Foto: Pareto (revista "l'autònoma")

El projecte està basat en el servidor web PDA (Pipeline Diversity Analysis), una eina informàtica que analitza dades a gran escala a partir d'informació arxivada en les grans bases de dades públiques de genòmica, com el GenBank. Consisteix en un conjunt de programes que, d'una manera automàtica, cerquen les seqüències que hi ha a les grans bases de dades públiques de DNA, les agrupen i mesuren la diversitat genètica en diferents regions del genoma. Aquesta eina s'ha modificat recentment per dotar-la de la capacitat d'executar-se de forma distribuïda sobre centenars d'ordinadors. D'aquesta forma, s'espera abordar estudis genètics que cobreixin organismes o gèneres animals més complexes, i que requereixin gran capacitat de computació.

La nova base de dades sobre la diversitat genètica està disponible perquè la pugui utilitzar la comunitat científica a l'adreça d'Internet http://dpdb.uab.es/dpdb.